转录组测序

转录组是指某个物种特定细胞或组织在某一状态下所转录出来产生的所有转录本的集合。对转录组进行转录组测序，获得参考序列后，可定量测定每个转录本在生长过程中和不同的条件下的表达水平的变化。通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或者器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

应用领域：

1. 样本全转录本信息获取

2. 基因注释及筛选

3. 基因差异表达研究

小RNA测序

小RNA是指长度在18-30nt的内源性非蛋白质RNA，广泛存在于高等和低等生物体内，对mRNA的转录及转录后水平等生命过程起调节作用。小RNA可归纳成三类：miRNA(微RNA)，siRNA(小干扰RNA)和与piRNA（piwi相互作用的RNA）。它们以通过沉默和降解其靶点基因分子的方式控制基因表达，在生物体正常生长发育和疾病发生过程中起着不可忽视的调控作用。新一代测序技术提供一套全新独特的，适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析的研究平台。通过深度的测序，可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱，推进了对小RNA功能的研究。

应用领域：

1. 基因转录后调控研究

2. 基因沉默研究

3. small RNA靶标分析和调控网络

LncRNA测序

长链非编码RNA（long non-coding RNA， LncRNA）是近年来引起广泛关注的一种具有独特的调控功能的非编码RNA。LncRNA的长度在200nt以上，不编码蛋白，物种间保守性较差，有的序列结构与mRNA相似（含有polyA尾，存在可变剪切），有的则无这些特征。目前的研究对LncRNA的产生和功能机制尚未有明确的认识，但已有多种具有重要生物功能（如癌症发生、X染色体沉默以及与其他调控因子作用构成复杂调控网络等）的LncRNA被发现。

应用领域：

1. 新lncRNA找寻与预测

2. 疾病研究

3. 调控网络研究

非靶向代谢组

非靶向代谢组是指对生物样本中的所有小分子化合物（分子量小于1000）进行定性和定量分析，并比较不同样本间代谢物差异、筛选出在不同组间具有重要生物学意义的显著差异代谢物的技术。由于代谢组受环境变化影响最大，而环境对生物体的影响也最终体现为代谢物的变化，因此代谢组学研究在动植物生长发育、疾病biomarker筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。

应用领域：

1. 胁迫应答机理研究

2. 药用植物药用成分合成机理及药物代谢研究

3. 蔬果花卉颜色改良育种

4. 动植物生长发育机理研究

5. 疾病biomarker筛选

6. 疾病发生发展机制研究

7. 药效与毒副作用研究

靶向代谢组

靶向代谢组学针对性分析生物样本中单个或少量目标代谢物，通过与标准品的比对分析等获得目标代谢物的绝对丰度信息。随着分析研究的逐步深入，代谢网络逐渐全面系统，生物学研究趋于具体代谢通路的细节探索。靶向代谢组学即在精细化的代谢组学研究中发挥着重要作用。

应用领域：

1. 生物标记的验证和绝对定量

2. 目标代谢通路

3. 组学间补充验证